نواعی از ویروس HPV که سبب سرطان می شوند متفاوت از سایر انواع ویروس HPV می باشند. انواع ویروس HPV که سبب بیماریهای مختلف می شوند عبارتند از:
زگیل معمولی: انواع 1، 2، 4، 26، 27، 29، 41، 57، 65، 75، 76، 77، 78
زگیل کف پا: انواع 1، 2، 4، 60، 63
سرطان ناخن: نوع 16
یک نوعی از سرطان پوست: انواع 5، 8، 9، 10، 14، 17، 20، 21، 22، 23، 24، 25، 37، 38
سرطان ریه: انواع 6، 11، 16، 18
سرطان حنجره: انواع 6 و 11
سرطان سینوس: انواع 16 و 18
سرطان ملتحمه چشم: نوع 16
سرطان دهان: انواع 16 و 18
سرطان مری: انواع 16 و 18
زگیل وسیع ناحیه مقعد: انواع 1، 2، 3، 4، 5، 6، 10، 11، 16، 18، 30، 31، 33، 35، 39، 40، 41، 42، 43، 44، 45، 51، 52، 53، 54، 55، 56، 57، 58، 59، 70 و 83
زگیل وسیع ناحیه تناسلی: انواع 6، 11، 57، 72 و 73
ضایعات پیش سرطانی (ضایعاتی که با پیشرفت تبدیل به سرطان می شوند): انواع 6، 11، 16، 18، 31، 33، 35، 39، 42، 44، 45، 51، 52، 56، 58، 59، 61، 64، 66، 68، 82
سرطان فرج: انواع 6، 11، 16، 18
سرطان واژن: نوع 16
سرطان دهانه رحم: انواع 16، 18، 31، 33، 35، 39، 45، 51، 52، 56، 58، 59، 66، 68، 70، 73 و 82
سرطان مقعد: انواع 16، 31، 32 و 33