داستان اتاق فرار «پادزهر» از این قرار است که یک بیماری خطرناک و همه گیر، همه افراد کره زمین را مبتلا کرده است و هنوز واکسن یا پادزهری برای آن پیدا نشده است. در این میان پزشکان، دانشمندان و محققان زیادی تلاش می کنند تا پادزهری برای این بیماری ناشناخته پیدا کنند اما موفق نمی شوند در این میانی تیمی از محققان و کاراگاهان نیز تشکیل می شود و از شما دعوت می کنند که عضواین تیم شوید و در کنار آنها برای نجات بشر تلاش کنید.
پادزهر این بیماری هولناک بلاخره توسط یک دانشمند نابغه به نام دکتر برایانیک کشف شده است اما گروهی خلافکار هم تلاش می کنند تا با پیدا کردن این دکتر و دستگیری او مانع از پخش شدن پادزهر بین بیماران و نجات بشریت شوند.
در میان تحقیقات، شما متوجه می شوید دکتر برایانیک به قتل رسیده است و شما موفق نشده اید که او را پیدا کنید حالا شما باید پیش از قاتلان او پادزهر را پیدا کنید و نوع بشر را نجات دهید.