در برخی از کودکان ادرار از مثانه به حالب ها و کلیه ها پس می زند ( رفلاکس ادرار از مثانه به حالب و کلیه ها که این خود سبب انتقال میکروبها به قسمتهای بالاتر دستگاه ادراری می شود که این مهمترین عامل مستعد کننده عفونت در کودکان است و برای تشخیص آن عکس رنگی ( VCUG ) از مثانه الزامی است. ختنه نشدن پسرها عامل مستعد کننده دیگری است . که احتمال عفونت ادراری را 10 برابر می کند . سایر عوامل شامل مشکلات در دفع ادرار ( مثل دیر ادرار کردن ، با خودداری از دفع ادرار به خصوص در دختر بچه ها ) ، برخی عفونت های انگلی ، سنگ یا انسداد در مسیر ادرار و... است.